Filogeografi Trigonopoma gracile dari Sungai Gedong, Bangka dan Catatan di Paparan Sunda berdasarkan gen COI
Abstract
Trigonopoma gracile merupakan salah satu speies ikan air tawar yang ditemukan hidup di perairan Pulau Bangka yang terdampak penambangan timah. Perlu dilakukan kajian terkait hubungan genetik ikan ini dengan wilayah lainnya di paparan Sunda. Sampel ikan dari Sungai Gedong, Bangka diidentifikasi karakteristik molekulernya dengan menggunakan gen COI (sitokrom oksidase I) dan dibandingkan dengan temuan di wilayah Sundaland lainnya. Trigonopoma gracile dari Sungai Gedong, Bangka memiliki hubungan yang dekat dengan ikan T. gracile dari Kalimantan Barat, Serawak, Belitung, dan Sempan, Bangka dengan jarak antara 0,93 – 1,89 %, namun berbeda kluster dengan Selangor, Bangka Selatan, Kemuja-Bangka, Trengganu,dan Serawak dengan jarak genetik 3,69 – 5,44 %. Hubungan antar pulau pada T. gracile diprediksi terjadi akibat hubungan sunga purba Sunda Utara dimasa lampau. Variasi genetik yang muncul di Pulau Bangka dimungkinkan sebagai adaptasi terhadap kondisi lingkungannya.
Downloads
References
REFERENSI
Aminan, A. W., Kit, L. L. W., Hui, C. H., & Sulaiman, B. (2020). Morphometric Analysis and Genetic Relationship of Rasbora spp. in Sarawak, Malaysia. Tropical life sciences research, 31(2), 33.
Asriani, E., & Kurniawan, A. (2015). Determinasi nilai pH untuk memprediksi kualitas perairan pada kolong pascatambang timah di Pulau Bangka. Journal of Aquatropica Asia, 1(2).
Harrison, T., Krigbaum, J., & Manser, J. 2006. Primate biogeography and ecology on the Sunda Shelf Islands: a paleontological and zooarchaeological perspective. In Primate biogeography (pp. 331-372). Springer, Boston, MA.
Hashim, M., Nayan, N., Saleh, Y., Mahat, H., Shiang, W. F. 2018. Water quality assessment of former tin mining lakes for recreational purposes in Ipoh City, Perak, Malaysia. Indonesian Journal of Geography 50(1): 25- 33
Hubert, N., Lumbantobing, D., Sholihah, A., Dahruddin, H., Delrieu-Trottin, E., Busson, F., ... & Keith, P. (2019). Revisiting species boundaries and distribution ranges of Nemacheilus spp.(Cypriniformes: Nemacheilidae) and Rasbora spp.(Cypriniformes: Cyprinidae) in Java, Bali and Lombok through DNA barcodes: implications for conservation in a biodiversity hotspot. Conservation Genetics, 20, 517-529.
Hutama A.A. Hadiaty R.K., & Hubert N. 2016. Biogeography Of Indonesian Freshwater Fishes: Current Progress. Treubia. 43: 17–30
Igiri, B.E., Okoduwa, S.I., Idoko, G.O., Akabuogu, E.P., Adeyi, A.O., Ejiogu, I.K. 2018. Toxicity and bioremediation of heavy metals contaminated ecosystem from tannery wastewater: a review. Journal of Toxicology 2018: 1-16
Inocencia, A., Gonggoli, A. D., Rangin, A. R., Dendie, D., Putra, E. D., Lorensi, M., ... & Kadafi, A. M. (2021). Inventarisasi Jenis Ikan Air Tawar di Kawasan Kampus Universitas Palangka Raya, Kalimantan Tengah. Jurnal Ilmu Hayat, 5(1), 35-42.
Juliantari E. 2015. Studi Filogenetik Mangifera Sumatera Tengah Berdasarkan Sekuen rbcL [Skripsi]. Pekanbaru: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Riau.
Kottelat, M., & Lim, K. K. (2021). Two new species of Barbodes from the Malay Peninsula and comments on ‘cryptic species’ in the B. binotatus group (Teleostei: Cyprinidae). RAFFLES BULLETIN OF ZOOLOGY, 69(1), 522-540.
Kurniawan, A., & Mustikasari, D. (2019). Review: Mekanisme akumulasi logam berat di ekosistem pascatambang timah. Jurnal Ilmu Lingkungan, 17(3), 408-415.
Kurniawan, A., Kurniawan, A. 2012. Analisis variasi genetik ikan di kolong pascatambang timah dengan metode elektroforesis. Akuatik: Jurnal Sumberdaya Perairan 6(2): 6-10
Kurniawan, A., Kurniawan, A., Hariati, A. M., Kurniawan, N., Nugroho, T. W., Bidayani, E., ... & Wiadnya, D. G. R. (2022). Genetic diversity analysis and phylogeography of Osteochilus spilurus (Cyprinidae: Labeoninae) from Bangka, Belitung, and Kalimantan Islands using Cytochrome b gene. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 23(9).
Lee, M. S., & Palci, A. (2015). Morphological phylogenetics in the genomic age. Current Biology, 25(19), R922-R929.
Mentari, M., Umroh, U., & Kurniawan, K. (2017). Pengaruh aktivitas penambangan timah terhadap kualitas air di Sungai Baturusa Kabupaten Bangka. Akuatik: Jurnal Sumberdaya Perairan, 11(2), 23-30.
Muslih, K., Adiwilaga, E. M., & Adiwibowo, S. 2016. Pengaruh penambangan timah terhadap keanekaragaman ikan sungai dan kearifan lokal masyarakat di Kabupaten Bangka. Limnotek: perairan darat tropis di Indonesia, 21(1).
Ng, C. K. C., & Tan, J. (2021). Cryptic species and grey zone speciation of the Barbodes binotatus complex (Teleostei, Cyprinidae) in Sundaland. Journal of fish biology, 99(4), 1256-1273.
Pramono, T.B., Arfiati, D.A., Widodo, M.S., Yanuhar, U.Y., 2017. Identifikasi Ikan Genus Mystus Dengan Pendekatan Genetik. Jurnal Kelautan Tropis. 24(1):141-150
Rafsanjani, A., 2011. Analisis Keragaman Genetic Ikan Mas (Cyprinus carpio) Di Waduk Saguling Dengan Menggunakan Metode Rapd-Pcr. Skripsi. Universitas Padjajaran.
Sholihah, A., Delrieu-Trottin, E., Sukmono, T., Dahruddin, H., Risdawati, R., Elvyra, R., ... & Hubert, N. (2020). Disentangling the taxonomy of the subfamily Rasborinae (Cypriniformes, Danionidae) in Sundaland using DNA barcodes. Scientific reports, 10(1), 1-14.
Sukarman., Gani, R.A., Asmarhansyah. 2020. Tin mining process and its effects on soils in Bangka Belitung Islands Province, Indonesia. Sains Tanah Journal of Soil Science and Agroclimatology, 17(2): 180-189
Syarif A. F. & Prasetiyono E. (2019). Karakter morfometrik, pertumbuhan, dan sintasan tiga spesies ikan seluang (Famili: Cyprinidae) asal Pulau Bangka. Media Akuakultur, 14 (1), 1-7.
Thompson, A.W., Hayes, A., Podrabsky, J.E., Orti, G. 2017. Gene expression during delayed hatching in fish-out-ofwater. Ecological Genetics and Genomics 3-5(2-17): 52-59.
Voris, 2000. Maps of Pleistocene sea levels in Southeast Asia: shorelines, river systems and time durations. Journal of Biogeography, 27, 1153–1167
Ward R.D., Zemlak T.S., Innes B.H., Last P. and Hebert P.D.N. (2005). DNA Barcoding Australia’s Fish Species. Phil. Trans. R. Soc. B 360: 1847-1857.
Copyright (c) 2023 Ardiansyah Kurniawan, Rina Apriyanti, Alya Maisan Safitri, Siti Puan NIK Almaghribi, Ahmad Fahrul Syarif, Andri Kurniawan
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Abstract viewed = 322 times
PDF (Bahasa Indonesia) downloaded = 373 times
